蘭嶼，位於台灣本島東南方的小島，風景優美，多雨，屬熱帶氣候。蘭嶼馬拉松在每年的夏天舉辦，舉辦日期大多選在五、六月間，蘭嶼的面積不大，約48平方公里左右，環島一圈的路程為43公里，恰恰接近一場全馬的路程距離，也因此蘭嶼馬拉松的賽事路程，便是環蘭嶼島一圈。

蘭嶼馬拉松總共會舉辦兩天，兩天的賽事路線都一樣，由於要到蘭嶼島的交通較不便，因此參賽人數相較一般本島的馬拉松賽事也較少。在比賽開始前，主辦單位也特別施放天燈來祈求今日的活動能夠順利，賽事開始後，沿途可以欣賞蘭嶼的島上風景及達悟族特色建築，跑一次蘭嶼全馬也順便把蘭嶼的各地特色景點一起玩了一遍。

 
(圖片來源:YouTube)

2015年的蘭嶼馬拉松，為了響應環保，主辦單位舉辦了「多背一公斤，蘭嶼亮晶晶」的公益活動，也特別邀請參賽選手一起參與，在跑馬的過程中，除了選手自帶水瓶不用紙杯外，並在賽後回程時也將自己的寶特瓶、回收物等帶回台灣本島，而不遺留在蘭嶼，借由這個馬拉松活動，也協助清理島上垃圾，保持良好的遊客與旅遊地的友善相處模式。

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